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조선시대에는 법제상 수군제도가 확립되어 《경국대전》에는 수군도 진관체제(鎭管體制)에 따라 각 도마다 주진(主鎭)·거진(巨鎭)·제진(諸鎭)으로 편제되어, 주진에는 수군절도사(水軍節度使), 거진에는 수군첨절제사(水軍僉節制使), 제진에는 만호(萬戶)가 배속되어 있었다. 그 뒤 1593년(선조 26)에는 통제영(統制營)을 두어 경상도·전라도·충청도의 수군을 통제사(統制使)로 하여금 지휘하도록 하여 남해안 방어를 강화하였고, 1627년(인조 5)에는 수도권 방위를 위하여 강화(江華)에 통어영(統禦營)을 두어 경기도·황해도의 수군을 통솔하게 하였다. 《경국대전》에 기록된 수군의 병력은 4만 8800명으로 연해민(沿海民)뿐만 아니라 산군인(山郡人)도 충원되었으며, <삭상체(二番一朔廂遞)>에 의하여 1개월 교대로 1년에 6개월을 복무하였다. 병선(兵船)은 수군의 해상근무에서 가장 중요한 장비로서, 병선의 건조를 위해 초기에는 전선사(戰船司)를 두었으나 뒤에는 비변사(備邊司)에서 이를 담당하였다.
 
 
 
 
 
 
 
호좌수영지에 실린 당시 보수내용

“사례에 병고는 바람이 높은 일삭은 방군 160명에 1명당 돈 2냥씩이다. 4두량 돈이 160냥이니 합하여 480냥내에, 330냥 급대군이 110명이니 매명 3냥씩이다.
바람이 화한 일삭은 방군 375명인데 매전 2냥씩 주면 합 750냥이다. 4두량전은 375냥으로 합 1,125냥대에, 396냥 급대군이 132명으로 매명에게 3냥씩 주면 도합 1년에 방군이 3,210명에 매영 돈 2냥씩 하면 합 6,420냥이다. (베로 수봉하면 60통 10필이다.)
4두량돈이 3,210냥이므로 합전이 9,630냥내에 1년 급대군이 1,420명에 매영 3냥씩 주니 돈을 합하면 4,356냥이다. 국마작목(國馬作木)이 50냥, 인정채(人情債)가 15냥 계방채(契房債)가 15냥, 삼비속목(三肥贖木)이 10냥, 인정태가(人情?價)가 22냥, 수마량료전(水馬粮料錢)이 2냥, 진상동개상송시작목(進上?箇上送時作木)이 10필로 대전이 20냥이고 인정목(人情木) 9필, 대전 18냥, 삼방물상송시태가(三方物上送時?價)가 36냥, 인정목 6필, 대전이 12냥, 영거색리(領去色吏) 9냥, 기노소(耆老所) 춘추약채목(春秋藥債木) 2필 대전이 양 등에 각 4냥, 유승가목(鍮升價木) 1필 대전이 양등각 2냥, 중추부(中樞付) 춘추약채목 2필 진전이 4냥 우후춘추의자전(虞侯春秋衣資錢)이 6냥, 도총부호피 1령가목 2필대전이 4냥 비국서리(備局書吏) 삭기채(朔奇債)가 1년에 144냥, 조선포가 풍화 6삭에 240냥, 신영당참가(新迎堂參價)가 120냥, 제수대전(祭需代錢)이 40냥, 사명가목(司命價木)이 1통, 지전이 100냥, 유서통작목(鍮書筒作木)이 1필 대전이 2냥, 마패작목(馬牌作木)이 1필 대전이 2냥, 단골서리 (관원이 항상 관아의 사무를 맡기던 이조 또는 병조의 서리)(丹骨書吏) 첩하전(帖下錢)이 56냥, 쇄마(刷馬) 7필의 첨가전이 80냥, 중영쇄마 1필, 첨가 6냥, 영리노자(營吏路資) 30냥, 마두(馬頭) 8냥, 이방쇄마(吏房刷馬) 1필 태가가 16냥, 청채(廳債)노자가 아울러 20냥, 통인(通人)의 쇄마 1필, 태가가 16냥, 노자 3냥 상경진무(鎭撫) 3인 노자가 9냥이다. 방자 1명 노자가 3냥, 구종(驅從) 1명 노자가 3냥, 중정영리(中程營吏) 노자가 3냥, 훈도예방 노자가 3냥씩이다. 구사또 행차영리가 14냥, 상영일(上營日)에 다담우가(茶啖牛價)가 15냥, 신우후쇄마(新虞侯刷馬) 1필 태가가 24냥, 배리(陪吏) 1인과 사령 3명에 12냥, 구우후쇄마 1필 태가가 24냥이고 전문작목(箋文作木)이 1필, 장계작목(狀啓作木)이 1필이다. 이밖에 종종은 기록하기 어렵다.
수용군은 순천 404명, 흥양군이 186명, 나주 4명, 남원 4명, 순창 23명, 능주 38명, 광양 22명, 전주 6명, 곡성 14명, 장흥 65명, 창평 6명, 구례 12명, 장수 4명, 운봉 3명, 임실 4명, 동복 5명으로 모두 800명내에 160명은 해현창(解懸倉)에서 258명은 군기(軍器)에서, 379명은 본고에서 매영 2냥씩으로 합 750냥내에 112냥은 국마인정잡비(國馬人情雜費)로 하고 나머지 644냥은 금년 10월부터 명년 9월까지 매삭 53냥 8전 3푼씩 상하한다. 휴번군 1,615명에게는 매영 베 1필씩이니 모두 합하면 32동 45필을 매면 겨울에 봉상하여 회록한다. 3동 대전300냥은 경기수영부조군병감포대(京畿水營赴操軍兵減布代)로 관령(關領)을 기다려 비국(備局)에 바치고 태가전 33냥도 아울러 모아 감하니 정축년을 위시하여 기록이 목(木)에 있다.“